Die IAF-Forschungsinstitute sollen die Sichtbarkeit der Forschung in einem definierten Themengebiet sowie die Vernetzung der Forschung innerhalb und außerhalb der Hochschule erhöhen und die Forschungsleistung durch Stärkung von großen Arbeitsgruppen der Hochschule verbessern. Zugleich soll mit diesen Instituten nach außen die Qualität demonstriert werden, die die Forschung an der HFU erreicht hat.