Bioanalytik Labor

zu Forschungsinstitute

Präzision für die Gesundheit

Das Bioanalytik Labor hat sich auf die detaillierte Analyse biologischer Proben mittels fortschrittlicher Technologien spezialisiert, die dazu dienen die Gesundheitsversorgung durch präzisere Diagnosen und individuell angepasste Behandlungen zu verbessern.

Solche Technologien ermöglichen die Erstellung individueller Gesundheitsprofile, unterstützen die Entwicklung maßgeschneiderter, effektiverer und schonenderer Therapien und spielen somit eine zentrale Rolle in der personalisierten Medizin. Krankheiten können frühzeitig erkannt werden, was die Heilungschancen erhöht und die Behandlungskosten senkt.

Zudem trägt das Labor zur Sicherheitsbewertung neuer Medikamente und Materialien bei und fördert die wissenschaftliche Forschung, was zu bedeutenden medizinischen Innovationen führt.

Schwerpunkte

Beschreibung

Massenspektrometrie

Eine der Kernmethoden des Labors ist die Massenspektrometrie, die sowohl für gerichtete als auch für ungerichtete Analysen des Metaboloms eingesetzt wird. Diese Technologie ermöglicht es, eine große Anzahl von Metaboliten (Stoffwechselprodukte) in klinischen Proben zu identifizieren und so Biomarker zu entdecken, die für die Diagnose und Prognose von Krankheiten von großer Bedeutung sind. Darüber hinaus wird die Massenspektrometrie im Labor auch für mechanistische Studien eingesetzt, wie die Erforschung der Wirkungsmechanismen von Toxinen, experimentellen Substanzen und die Bewertung der Biokompatibilität von Materialien.


Herstellung und Analyse von Microarrays

Ein weiterer Schwerpunkt des Labors ist die Herstellung und Analyse von Microarrays auf der Basis von DNA, Proteinen und Peptiden. Diese Mikroarrays werden mit Hilfe eines piezogesteuerten Mikrodispensers präzise hergestellt. Diese Technik ermöglicht die gleichzeitige Analyse einer großen Anzahl biologischer Moleküle und ist ein wesentlicher Bestandteil der Entwicklung von Point-of-Care-Assays für die personalisierte Medizin. Diese Tests zielen darauf ab, individuelle Gesundheitsprofile zu erstellen und maßgeschneiderte therapeutische Ansätze zu ermöglichen.

Festkörpernanoporen

Abseits von den beschriebenen etablierten Methoden wird aktuell im Bioanalytik-Labor im Rahmen der Förderprojekte VarioPore & PROPORES an den Einsatzmöglichkeiten von Festkörpernanoporen für analytische Anwendungen geforscht.

Laborfunktionen

  • Gerichtete und ungerichtete Analyse des Metaboloms aus biologischen Proben
  • Untersuchung und Verifikation von Produkten aus der organischen Synthese
  • Entwicklung von Hochleistungsflüssigchromatographie (HPLC)-gekoppelter Massenspektrometrie-basierten Multi-Methoden zur quantitativen Analytik kleiner Moleküle
  • Identifikation von Biomarkern für diagnostische Zwecke (z.b. Sauerstoffmangel bei Neugeborenen)
  • Mechanistische Untersuchungen von Einflüssen auf Stoffwechselwege (z.B. Toxine, Weichmacher, experimentelle Substanzen)
  • Untersuchung von Signalwegen
  • Herstellung von Mikroarrays auf Basis von Proteinen, Nukleinsäuren oder Peptiden für unterschiedliche Anwendungen

Weiterführende Links

Ausstattung

Geräte

UPLC-gekoppeltes Synapt XS 

Die Waters Synapt XS-Plattform umfasst ein Quadrupol-Time of Flight-Massenspektrometer mit Ionenmobilitätsfunktionen, welches mit einem Acquity H-Class UPLC-System gekoppelt ist. Das System ermöglicht die ungerichtete Analyse des Metaboloms ohne eine Ausgangshypothese. Die Plattform wurde 2022 im Rahmen eines DGF Großgeräteaktion für Hochschulen für Angewandte Wissenschaften (GGA-HAW) Grant (498224366, PI Prof. Dr. Margareta Müller) eingerichtet. Das System ist so konzipiert, dass es modernste Metabolomics- und Lipidomics-Funktionen mit RP- und HILIC-Trennoptionen bietet. Die Plattform stützt sich auf Progenesis QI für die automatische Datenanalyse, einschließlich der statistischen Auswertung der Experimente. Darüber hinaus ermöglicht diese Plattform auch die Charakterisierung von Produkten aus der organischen Synthese.

HPLC-gekoppeltes 4000 QTRAP

Die SCIEX 4000 QTRAP-Plattform besteht aus einem hybriden Triple-Quadrupol/Linear-Ionenfallen-Massenspektrometer, das mit einem Shimadzu NexeraXR HPLC-System gekoppelt ist. Das System ermöglicht eine gerichtete, quantitative Analyse des Metaboloms mit entsprechender Eingangshypothese.  Die Plattform stützt sich auf MultiQuant für die quantitative Datenanalyse. Eine Liste der derzeit etablierten Analyten ist auf der Website des Institute of Precision Medicine zu finden.

sciFLEXARRAYER S3

Der sciFLEXARRAYER S3 ist ein automatisierter, piezogetriebener, berührungsloser Mikrodispenser für sehr kleine Volumina (im Pikoliter Bereich). Er kann z.B. zur Herstellung von Microarrays eingesetzt werden, eignet sich aber auch für die Festphasensynthese (z.B. Peptide) im Kleinstformat.

sciREADER FL2 

Der sciREADER FL2 ermöglicht eine hochwertige digitale Bildgebung von Fluoreszenzassays mit bis zu drei Farben (rote, grüne und blaue Fluoreszenzfarbstoffe). Die hohe Auflösung (10 µm Pixelgröße) macht das Gerät ideal für die Auswertung von Microarrays. Die Möglichkeit, das Array-Layout individuell zu gestalten, ermöglicht Assays in Well-Plattenformaten, auf Objektträgern oder anderen Formaten (z. B. Lateral-Flow-Arrays).

Biotage PRESSURE+

Der Biotage Pressure+ ist ein Überdruck-Verteiler, welcher für die Festphasenextraktion oder Trocknung im 96-Well-Format verwendet werden kann. Durch die Verwendung des Inertgases Stickstoff wird die Oxidation von Analyten verhindert, was eine schonende Aufreinigung von labilen Analyten ermöglicht.

RVC 2-25 CDPlus

Bei der RVC 2-25 CDplus handelt es sich um eine Vakuumzentrifuge, welche zum Konzentrieren, Trocknen oder Lyophilisieren von Lösungen eingesetzt werden kann. In Kombination mit dem Eiskondensator Alpha 2-4 LSCplus und einer nachgeschalteten Drehschieberpumpe lassen sich mit diesem System nicht nur organische Lösungsmittel wie Methanol oder Ethylacetat entfernen, sondern auch wässrige Lösungen durch Lyophilisation schonend trocknen. Aufgrund der verfügbaren Rotoren können derzeit Reaktionsgefäße in den Größen 1,5 ml, 2,2 ml, 15 ml sowie Standard-Mikrotiterplattenformate eingesetzt werden.

Projekte

Abgschlossene Projekte

AAMBI & BANON

Klinische Studien
Laufzeit: 06/2017 – 09/2022

Die Studien AAMBI und BANON wurden in Zusammenarbeit mit türkischen und deutschen Kliniken sowie InfanDx durchgeführt. Ziel war die Identifikation von Metaboliten-basierten Biomarkern zur frühzeitigen Erkennung von neonataler Asphyxie (Sauerstoffmangel bei der Geburt).

Auswirkungen von DEHP

Folgen von Weichmachern auf die myeloide Hämatopoese
Laufzeit: 07/2017 – 07/2022

Die Exposition gegenüber Xenobiotika wie Di-2-ethylhexylphthalat (DEHP), einem Weichmacher, stellt eine Gesundheitsherausforderung dar. Ziel des Projekts war es, die Auswirkungen von DEHP auf die myeloide Hämatopoese und die zugrunde liegenden Mechanismen zu untersuchen.

WMP

Das Waschmaschinen-Mikrobiom Projekt
Laufzeit 10/2018 – 09/2021

Im WM-Projekt wurde erstmals das Mikrobiom von Waschmaschinen und getragenen Textilien unter realistischen Bedingungen untersucht. Die Analyse umfasste die Struktur und Funktion mikrobieller Gemeinschaften in Waschmaschinen, um die Auswirkungen der Waschprozesse und zentrale Einflussfaktoren zu identifizieren.

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CoHMed MS-Tox Test

Optimierung von Zytotoxizitätstests
Laufzeit:04/2019 - 06/2021

Im Projekt mit CleanControlling Medical GmbH wurde der DIN-ISO Zytotoxizitätstest optimiert. Massenspektrometrie identifizierte Metaboliten als Biomarker für Toxizität, um Tests präziser und materialeffizienter zu gestalten und zelluläre Mechanismen besser zu erfassen.

FlowArray

Identifizierung multiresistenter Keime
Laufzeit: 11/2019 – 10/2022

Ziel des Projekts war die Entwicklung funktionaler Multiplex Lateral Flow Mikroarrays (LFMAs) zur Point-of-Care-Diagnostik multiresistenter bakterieller Infektionen. Diese ermöglichen schnelle Tests auf Keime, Resistenzen und Aktivität von Betalaktamase-Inhibitoren.

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CompanionDx Hypothermie

Sauerstoffunterversorgung von Neugeborenen
Laufzeit: 02/2020 – 01/2022

Ziel des Projekts war es, einen InfanDx-Test um Parameter zu erweitern, um Neugeborene mit hypoxisch-ischämischer Enzephalopathie frühzeitig zu identifizieren und die beste Therapie zu wählen. Biomarker wurden in Blut- und Gewebsproben aus einem Tiermodell analysiert.

Techpat nano

Nanosensor basierte Diagnostik
Laufzeit: 05/2020 – 04/2022

Ein Teilziel dieses Projekts war die Entwicklung eines therapiebegleitenden, nichtinvasiven Monitoring-Test nach einer Nierentransplantation, wobei die frühzeitige Erkennung der Transplantatabstoßung durch Bestimmung des molekularen Markers „Kynurenin“ erfolgt, einem Abbauprodukt der Aminosäure Tryptophan.

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Laufende Projekte

Lebensdauer-MDR

Lebensdauer chirurgischer Instrumente
Laufzeit 01/2022 – 12/2024

Ziel des Projekts ist die modellhafte Beschreibung der Einflüsse von Reinigung, Desinfektion und Sterilisation auf die Lebensdauer und das Einsatzverhalten von chirurgischen Instrumenten. Dies soll konkrete Vorhersagen zu deren sicherer und optimaler Gebrauchsdauer ermöglichen. Im Bioanalytik-Labor wurden Werkstoffproben auf Rückstände untersucht.

WEGAS

Antibiotische Wirkstoffe zur Mikrobiommanipulation
Laufzeit: 04/2022 – 03/2025

Im Projekt wird untersucht, ob das Konzept der „Wechselseitigen Ernährung“ zur Manipulation menschlicher Mikrobiome geeignet ist. Dabei wird die Wirkung von Roseoflavin auf das Mundhöhlenmikrobiom und humane Zellen analysiert, um seine Anwendung in der Oralhygiene zu prüfen.

PepKatCO2

Katalytische CO2-Prozessierung
Laufzeit: 04/2022 – 03/2025

Im Rahmen dieses Antrages werden die Möglichkeiten der kombinatorischen Chemie genutzt, um eine Bibliothek aus mehreren 100 verschiedenen Peptiden, bestehend aus 4-8 Aminosäuren herzustellen und anhand einer neuartigen Screening-Methode auf Ihre CO2-bindenden und letztendlich CO2-prozessierenden Eigenschaften hin zu untersuchen.

Markerpanels in 3D Tumor-Stromamodell

Laufzeit: 10/2023 - 11/2026

Das Projekt zielt auf die Etablierung eines Markerpanels zur Früherkennung der Reaktion auf Anti-Tumor- und Anti-Stroma-Therapien in einem 3D Tumor-Stromamodell ab. Dieses Modell, das den "angiogenic switch" in vitro darstellt, dient als Referenz für die Entwicklung von Therapeutika und personalisierten Therapieansätzen.

NASH

Nachhaltige Strategien für Wäschehygiene
Laufzeit 05/2024 – 05/2027

Das Projekt soll untersuchen, wie Enzyme und probiotische Bakterien die Hygiene von Maschinen und Wäsche verbessern können, ohne hohe Temperaturen oder aggressive Chemikalien zu nutzen. Ziel ist es, energiesparendes Waschen mit hoher Hygieneleistung zu ermöglichen.

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MetaLife

Apoptosis
Projektstats: Bewilligt

Das Projekt untersucht, wie sterbende Zellen Signale senden, die Zellproliferation oder Entzündungshemmung auslösen. Im Fokus stehen kleine Moleküle im apoptotischen Sekretom von Blutzellen, die als potenzielle Therapeutika dienen könnten. Ziel ist es, Unterschiede und Gemeinsamkeiten der Signalmoleküle bei verschiedenen Zelltodarten zu identifizieren.

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